Existem várias categorias de fístula anal. Essas categorias incluem alta fístula anal e baixa fístula anal. A fístula anal alta é a área em que a cavidade retal está localizada na região superior. O risco de incontinência fecal é muito alto. Fístula O ânus inferior está no fundo da cavidade retal e o risco de incontinência fecal é menor
A outra classificação é simples e complexa, o complexo é chamado quando o canal da fístula corta todas as válvulas anais internas e externas, ou quando o tratamento da fístula é difícil ou se a fístula afeta os órgãos adjacentes a ela. A última classificação é a classificação mais comum da fístula, uma vez que passa pelas válvulas ou por fora. O primeiro tipo é a fístula nas garras e forma 45% das espécies, e reflete a fístula durante a válvula anal interna, mas não passa através da válvula anal externa
O segundo tipo é o tipo triturador, que constitui 45% de todas as espécies. Ele passa pelos egípcios internos e externos juntos e depois para a área da cavidade retal para alcançar a pele do mecanismo. O terceiro tipo é o tipo que passa sobre as seringas. E o quarto tipo é o tipo que sai do esfíncter e se estende do bocal interno do intestino até o reto imediato e inclui todo o aparato das catacumbas.