Quanto à localização da úlcera, está no sistema geniturinário. Nos homens, a úlcera de sífilis aparece no pênis, especialmente na frente (glande do pênis) ou dentro da uretra, seguida por uma secreção viscosa do ducto, seja na mulher, na úlcera na vulva, na uretra e no colo do útero. Nas mulheres, o primeiro estágio nem sempre aparece e a doença é diagnosticada no segundo estágio. A sífilis foi encontrada nos lábios, ânus, dedos, faringe, língua e mamilos em 10% dos infectados.
Após cerca de uma semana de úlceras, os gânglios linfáticos incham e, como o sistema reprodutivo está infectado, as glândulas linfáticas inchadas são os gânglios linfáticos da virilha para a área pubiana superior nas laterais e na parte superior das coxas, e geralmente curam as úlceras dentro de 4 -8 semanas automaticamente ou com a cura.